道光十九年，圣上为除“三害”，命林则徐赴广州禁烟，两江总督陶澍整顿盐政，又命户部侍郎爱新觉罗•铁麟为仓场总督，赴通州漕运码头铲除日益猖獗、积重难返的漕弊。
　　漕运码头上官衙林立，文武交织，三教九流，盘根错节，形成了一个贪污腐败、危机四布、黑幕重重的独立王国。
　　铁麟乃宗室贵胄，为了不负圣恩，重塑先祖辉煌，他口衔天宪，上任伊始即大刀阔斧地清弊惩奸，以期建功立名。
　　户部尚书王鼎对铲除漕弊早有准备，几年前就在坐粮厅安插了心腹，并收集了武英殿大学士穆彰阿一手遮天，贪污漕粮巨款的确凿证据。然而，线人黄槐岸的神秘失踪、坐粮厅汉厅承许良年的阴险歹毒、青帮头目周三爷的呼风唤雨，通州知州夏雨轩的运筹巧计，服侍铁麟的奶妈韩小月的神秘身世以及江湖巫医唐大姑的若隐若现，却将漕运码头搅得雾障迷离，悬疑丛生。
　　就在铁麟舍身舍名力挽沉疴之际，其爱女甘戎及不肖子甘瑞又从黑白两道搅进了漕运码头，从而引发了一系列怪异诡秘乃至人命大案……漕运码头上，一场针锋相对的生死搏杀就此展开。
　　《漕运码头》是国内第一部反映漕运历史的电视剧。该剧以时世巨变的道光一朝为背景，以反腐除弊为题材，生动展示了大清王朝由盛向衰之际，从王室到中枢，从官场到民间的种种忧患及挣扎。全剧结构缜密，情节紧凑，塑造了一组刚正不阿、耿直忠勇的正面人物群像。剧中既有扣人心弦的传奇故事，又有京韵十足的地域特色，同时展示了丰富的传统民俗文化，体现出深厚的文化底蕴和高雅的艺术品位，具有极强的批判现实主义色彩。